Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R17PQ8TDU5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms