Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD22

SFXN5, Sideroflexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN5Q8TD22 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFXN5Q8TD22 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN5Q8TD22 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms