Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT8

SPPL2A, Signal peptide peptidase-like 2A, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL2AQ8TCT8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPPL2AQ8TCT8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL2AQ8TCT8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPPL2AQ8TCT8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms