Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC110Q8TBZ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC110Q8TBZ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms