Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STAG3L4Q8TBR4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms