Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS2

GOT1L1, Putative aspartate aminotransferase, cytoplasmic 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1L1Q8NHS2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOT1L1Q8NHS2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1L1Q8NHS2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1L1Q8NHS2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms