Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP0

TTC13, Tetratricopeptide repeat protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13Q8NBP0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTC13Q8NBP0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC13Q8NBP0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC13Q8NBP0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms