Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG16L2Q8NAA4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG16L2Q8NAA4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms