Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAF1Q8N7H5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAF1Q8N7H5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms