Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF148Q8N7C7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF148Q8N7C7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF148Q8N7C7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF148Q8N7C7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF148Q8N7C7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF148Q8N7C7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF148Q8N7C7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF148Q8N7C7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF148Q8N7C7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF148Q8N7C7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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