Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD3Q8N144 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD3Q8N144 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD3Q8N144 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD3Q8N144 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD3Q8N144 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD3Q8N144 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD3Q8N144 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms