Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP3Q8IZU3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP3Q8IZU3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms