Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMYD4Q8IYR2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMYD4Q8IYR2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms