Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY84

NIM1K, Serine/threonine-protein kinase NIM1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIM1KQ8IY84 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NIM1KQ8IY84 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NIM1KQ8IY84 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NIM1KQ8IY84 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NIM1KQ8IY84 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NIM1KQ8IY84 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NIM1KQ8IY84 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NIM1KQ8IY84 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NIM1KQ8IY84 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NIM1KQ8IY84 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NIM1KQ8IY84 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NIM1KQ8IY84 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NIM1KQ8IY84 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NIM1KQ8IY84 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NIM1KQ8IY84 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NIM1KQ8IY84 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NIM1KQ8IY84 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NIM1KQ8IY84 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NIM1KQ8IY84 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NIM1KQ8IY84 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NIM1KQ8IY84 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NIM1KQ8IY84 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NIM1KQ8IY84 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NIM1KQ8IY84 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NIM1KQ8IY84 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NIM1KQ8IY84 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms