Protein–RNA interactions for Protein: Q86X29

LSR, Lipolysis-stimulated lipoprotein receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSRQ86X29 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSRQ86X29 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSRQ86X29 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LSRQ86X29 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms