Protein–RNA interactions for Protein: Q86WT6

TRIM69, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM69, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM69Q86WT6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM69Q86WT6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM69Q86WT6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM69Q86WT6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms