Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC40.49■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PBRM1Q86U86 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC40.39■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.06
PBRM1Q86U86 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PBRM1Q86U86 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
PBRM1Q86U86 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PBRM1Q86U86 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PBRM1Q86U86 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PBRM1Q86U86 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PBRM1Q86U86 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
PBRM1Q86U86 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PBRM1Q86U86 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PBRM1Q86U86 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
PBRM1Q86U86 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
PBRM1Q86U86 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
PBRM1Q86U86 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PBRM1Q86U86 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
PBRM1Q86U86 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PBRM1Q86U86 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
PBRM1Q86U86 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PBRM1Q86U86 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC40.32■■■■■ 4.05
PBRM1Q86U86 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
PBRM1Q86U86 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
PBRM1Q86U86 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
PBRM1Q86U86 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PBRM1Q86U86 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
PBRM1Q86U86 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PBRM1Q86U86 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
PBRM1Q86U86 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms