Protein–RNA interactions for Protein: Q86TC9

MYPN, Myopalladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYPNQ86TC9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYPNQ86TC9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYPNQ86TC9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYPNQ86TC9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYPNQ86TC9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYPNQ86TC9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYPNQ86TC9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MYPNQ86TC9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYPNQ86TC9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYPNQ86TC9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYPNQ86TC9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYPNQ86TC9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms