Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMC4Q7Z404 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TMC4Q7Z404 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMC4Q7Z404 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms