Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PREX2Q70Z35 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PREX2Q70Z35 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PREX2Q70Z35 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PREX2Q70Z35 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
PREX2Q70Z35 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PREX2Q70Z35 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PREX2Q70Z35 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PREX2Q70Z35 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PREX2Q70Z35 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
PREX2Q70Z35 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PREX2Q70Z35 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PREX2Q70Z35 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
PREX2Q70Z35 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PREX2Q70Z35 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PREX2Q70Z35 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PREX2Q70Z35 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PREX2Q70Z35 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
PREX2Q70Z35 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PREX2Q70Z35 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PREX2Q70Z35 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PREX2Q70Z35 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PREX2Q70Z35 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PREX2Q70Z35 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
PREX2Q70Z35 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PREX2Q70Z35 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PREX2Q70Z35 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
PREX2Q70Z35 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms