Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEM1Q6ZVN7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SEM1Q6ZVN7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEM1Q6ZVN7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEM1Q6ZVN7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEM1Q6ZVN7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEM1Q6ZVN7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEM1Q6ZVN7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEM1Q6ZVN7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEM1Q6ZVN7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEM1Q6ZVN7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEM1Q6ZVN7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEM1Q6ZVN7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEM1Q6ZVN7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEM1Q6ZVN7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEM1Q6ZVN7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEM1Q6ZVN7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms