Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIAA0408Q6ZU52 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIAA0408Q6ZU52 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 374.8 ms