Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPP1R3FQ6ZSY5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPP1R3FQ6ZSY5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R3FQ6ZSY5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms