Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNW5

GDPGP1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPGP1Q6ZNW5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GDPGP1Q6ZNW5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDPGP1Q6ZNW5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GDPGP1Q6ZNW5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDPGP1Q6ZNW5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDPGP1Q6ZNW5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDPGP1Q6ZNW5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDPGP1Q6ZNW5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDPGP1Q6ZNW5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDPGP1Q6ZNW5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms