Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNW5

GDPGP1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPGP1Q6ZNW5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GDPGP1Q6ZNW5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDPGP1Q6ZNW5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GDPGP1Q6ZNW5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDPGP1Q6ZNW5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDPGP1Q6ZNW5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDPGP1Q6ZNW5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDPGP1Q6ZNW5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDPGP1Q6ZNW5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDPGP1Q6ZNW5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPGP1Q6ZNW5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPGP1Q6ZNW5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms