Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF111Q6ZNA4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms