Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYHR1Q6ZMK1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYHR1Q6ZMK1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYHR1Q6ZMK1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYHR1Q6ZMK1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYHR1Q6ZMK1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYHR1Q6ZMK1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYHR1Q6ZMK1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYHR1Q6ZMK1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYHR1Q6ZMK1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CYHR1Q6ZMK1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYHR1Q6ZMK1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYHR1Q6ZMK1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYHR1Q6ZMK1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYHR1Q6ZMK1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYHR1Q6ZMK1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYHR1Q6ZMK1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYHR1Q6ZMK1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYHR1Q6ZMK1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms