Protein–RNA interactions for Protein: Q6WBX8

RAD9B, Cell cycle checkpoint control protein RAD9B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9BQ6WBX8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD9BQ6WBX8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD9BQ6WBX8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD9BQ6WBX8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD9BQ6WBX8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD9BQ6WBX8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD9BQ6WBX8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD9BQ6WBX8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD9BQ6WBX8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD9BQ6WBX8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD9BQ6WBX8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD9BQ6WBX8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD9BQ6WBX8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD9BQ6WBX8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD9BQ6WBX8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD9BQ6WBX8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD9BQ6WBX8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD9BQ6WBX8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD9BQ6WBX8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD9BQ6WBX8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAD9BQ6WBX8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD9BQ6WBX8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAD9BQ6WBX8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD9BQ6WBX8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD9BQ6WBX8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms