Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMC5Q6UXY8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMC5Q6UXY8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms