Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VITQ6UXI7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VITQ6UXI7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms