Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX40

TMEM107, Transmembrane protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM107Q6UX40 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM107Q6UX40 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM107Q6UX40 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM107Q6UX40 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms