Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP8

SBSN, Suprabasin, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSNQ6UWP8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SBSNQ6UWP8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SBSNQ6UWP8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms