Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRSAM1Q6UWE0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms