Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SARM1Q6SZW1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SARM1Q6SZW1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SARM1Q6SZW1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SARM1Q6SZW1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SARM1Q6SZW1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SARM1Q6SZW1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SARM1Q6SZW1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SARM1Q6SZW1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms