Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C19orf48Q6RUI8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf48Q6RUI8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms