Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
EDC4Q6P2E9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
EDC4Q6P2E9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
EDC4Q6P2E9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
EDC4Q6P2E9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.7 ms