Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXS1

PPP1R2P3, Protein phosphatase inhibitor 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R2P3Q6NXS1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R2P3Q6NXS1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPP1R2P3Q6NXS1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP1R2P3Q6NXS1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP1R2P3Q6NXS1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R2P3Q6NXS1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R2P3Q6NXS1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R2P3Q6NXS1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R2P3Q6NXS1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R2P3Q6NXS1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R2P3Q6NXS1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R2P3Q6NXS1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms