Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI2

GPAT2, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT2Q6NUI2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GPAT2Q6NUI2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPAT2Q6NUI2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPAT2Q6NUI2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GPAT2Q6NUI2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GPAT2Q6NUI2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPAT2Q6NUI2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPAT2Q6NUI2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPAT2Q6NUI2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GPAT2Q6NUI2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPAT2Q6NUI2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPAT2Q6NUI2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPAT2Q6NUI2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPAT2Q6NUI2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPAT2Q6NUI2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPAT2Q6NUI2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPAT2Q6NUI2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPAT2Q6NUI2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPAT2Q6NUI2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms