Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC8EQ6NSJ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms