Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPN13Q6MZZ7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN13Q6MZZ7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms