Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDF6Q6KF10 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDF6Q6KF10 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF6Q6KF10 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GDF6Q6KF10 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GDF6Q6KF10 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms