Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFRP4Q6FHJ7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms