Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PCNX4Q63HM2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms