Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
USPL1Q5W0Q7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
USPL1Q5W0Q7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
USPL1Q5W0Q7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
USPL1Q5W0Q7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
USPL1Q5W0Q7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
USPL1Q5W0Q7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
USPL1Q5W0Q7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
USPL1Q5W0Q7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
USPL1Q5W0Q7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
USPL1Q5W0Q7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
USPL1Q5W0Q7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
USPL1Q5W0Q7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
USPL1Q5W0Q7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
USPL1Q5W0Q7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
USPL1Q5W0Q7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
USPL1Q5W0Q7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
USPL1Q5W0Q7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
USPL1Q5W0Q7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
USPL1Q5W0Q7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
USPL1Q5W0Q7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
USPL1Q5W0Q7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
USPL1Q5W0Q7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
USPL1Q5W0Q7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
USPL1Q5W0Q7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms