Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF220Q5VTB9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RNF220Q5VTB9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms