Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC04

ATP1A1-AS1, Putative uncharacterized protein ATP1A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1-AS1Q5TC04 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP1A1-AS1Q5TC04 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A1-AS1Q5TC04 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A1-AS1Q5TC04 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A1-AS1Q5TC04 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A1-AS1Q5TC04 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A1-AS1Q5TC04 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A1-AS1Q5TC04 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A1-AS1Q5TC04 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A1-AS1Q5TC04 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A1-AS1Q5TC04 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A1-AS1Q5TC04 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A1-AS1Q5TC04 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A1-AS1Q5TC04 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A1-AS1Q5TC04 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms