Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5Y3

CAMSAP1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP1Q5T5Y3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CAMSAP1Q5T5Y3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CAMSAP1Q5T5Y3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CAMSAP1Q5T5Y3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CAMSAP1Q5T5Y3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CAMSAP1Q5T5Y3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms