Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDSS1Q5T2R2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDSS1Q5T2R2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms