Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIVEP3Q5T1R4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIVEP3Q5T1R4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms