Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWA1

PPP1R15B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 15B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R15BQ5SWA1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R15BQ5SWA1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP1R15BQ5SWA1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R15BQ5SWA1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms