Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf38Q5JPI3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms